Amel Hamza-Chaffai détient un doctorat (1993) et une habilitation à diriger des recherches (1999) en écotoxicologie marine. Elle est professeure titulaire à l’Université de Sfax. Elle est également professeure invitée à l’Université d’Akita (Japon), à l’Université de Technologie (Malaisie) et dans différentes universités françaises (Le Havre, Le Mans et Caen).
En 2007, elle a publié un cours en ligne intitulé « Zoologie des invertébrés ». Pendant 33 ans, sa principale orientation de recherche a porté sur la biomonitoring de la pollution marine, les biomarqueurs, les perturbateurs endocriniens, la pollution et les maladies du cancer. Elle a publié plus de 85 articles scientifiques évalués par des pairs. Elle a dirigé 3 projets de recherche nationaux et 9 projets internationaux construits avec son réseau international. Elle est également la conceptrice d’un musée régional des sciences marines. Elle est la présidente-fondatrice d’une ONG de recherche appelée « Environment and Bio Innovation », approuvée en tant que partenaire de l’UNEP/MAP, dont les activités sont axées sur la sensibilisation à l’éducation et l’entrepreneuriat.
Le Pr. Hamza-Chaffai a été impliquée dans différents programmes européens en tant que partenaire (FP7 IRSES PEOPLE); évaluatrice (EARANET-MED, PRIMA, MSCA-IF); et membre externe du comité consultatif (et ERASMUS+). Elle a participé à différents ateliers méditerranéens organisés par l’UNEP-IOC/UNOSCO. Elle a activement participé à différents ateliers sur l’entrepreneuriat dans les sciences de la vie (Massachusetts Institute of Technology-2016); sur la gestion de la recherche (Académie des sciences de Malaisie-2009); et sur l’apprentissage en ligne (Université de Géorgie-2006). Elle a mis en place différentes sessions de formation sur « transformer les idées en entreprise » pour les étudiants de niveau master (Université de Caen-France). En 2007, elle a reçu la Médaille nationale du mérite en éducation et en sciences, Tunisie. En 2020, elle a été élue membre de l’Académie tunisienne des sciences, où elle préside la commission des sciences de l’environnement. En décembre 2022, elle a été élue Vice-Présidente de la Taskforce Décennie de l’océan pour l’Afrique et les États insulaires adjacents (ONU). Elle supervisera la région de la Méditerranée et de la mer Rouge.